Argonaute hits-clip解码microRNA – mRNA相互作用图

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　　microRNA（miRNA）在基因表达的调节中具有关键作用。但是，由于miRNA活性只需要与信使RNA的6-8个核苷酸配对，因此预测目标mRNA是一个主要挑战。最近，通过交联免疫沉淀（HITS-CLIP）分离的RNA的高通量测序已鉴定出功能性蛋白质 - RNA相互作用位点。在这里，我们使用hits-clip在小鼠脑中共价交联的天然Argonaute（AGO，也称为eIF2C）蛋白-RNA复合物。这产生了两个同时的数据集（Aga -MiRNA和Ago -MRNA结合位点）与生物信息学分析相结合，以识别miRNA和靶mRNA之间的相互作用位点。我们验证了miR-124的全基因组相互作用图，并为p13小鼠脑中存在的20个最丰富的miRNA生成了其他图。AGO HITS-CLIP提供了一个通用平台，用于探索体内miRNA作用的特异性和范围，并确定用于靶向临床相关的miRNA-mRNA相互作用的精确序列。

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