扎根的真核生物树揭示了他们的挖掘祖先

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　　真核生物的生命树（Etol）描绘了所有真核生物之间的关系；它的根代表了最后一个真实的共同祖先（LECA），所有现有的复杂生命形式都均为1。定位该根对于重建LECA的特征至关重要，既是真核生态发生的终点，也是千篇一律特征的演变的起点，这是生命真核生物多元化的基础。然而，由于进化模型不足，分类单元采样和系统发育信号有限，根部由于普遍的系统发育人工制品而引起争议。在这里，我们根据包括所有已知的真核超组的新的，更大的，更大的线粒体蛋白数据集估算了Etol的根源。我们对具有最先进的系统发育模型的100个分类单元×93蛋白数据集的分析表明，对替代假设的广泛评估表明，真核根源位于两个多植物组合之间：“ opimoda+”和“ diphoda+”。在不同的模型和鲁棒性分析中，一致支持该位置。值得注意的是，包含“典型挖掘”的组放在根部的两侧，这表明“挖掘”细胞结构的复杂特征追溯到LECA。这项研究阐明了现存真核生物从中产生的祖先细胞，并为研究规范真核特征的起源和演变提供了关键框架。

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