流感的预测健身模型

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　　季节性人类流感A/H3N2病毒经历了快速进化，这在循环菌株的种群中产生了明显的年度序列周转。适应性突变应对人类免疫攻击，主要发生在抗原表位，即病毒表面蛋白血凝素的抗体结合结构域。在这里，我们开发了血凝素的健身模型，该模型可以预测病毒种群从一年到下一年的演变。证明有两个因素可以确定菌株的适应性：自适应表位变化和表位之外的有害突变。我们使用所有先前菌株的种群遗传数据来推断给定年份循环的菌株的两个适应性成分。从每个菌株的适应性和频率中，我们预测了其次年下降菌株的频率。这种健身模型绘制了流感的自适应史，并提出了一种疫苗选择的原则方法。我们的结果要求对流感和其他快速发展的病原体进行更全面的流行病学，该病原体将抗原表型与其他病毒功能相结合，并结合遗传链接。

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