养老院居民皮肤上的克隆念珠菌和埃斯卡普病原体

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　　抗菌素抵抗是疗养院和其他医疗保健环境中发病率，死亡率和经济负担增加的公共卫生威胁1。由于抗菌细菌和真菌，疗养院的居民有病原体定植和感染的风险增加。疗养院充当医疗网络和整个地理区域中抗菌素耐药性的水库，放大器和抗菌素耐药性2。在这里，我们研究了具有呼吸机能力的疗养院中新兴，耐多药的人真菌病原体念珠菌Auris的基因组流行病学。耦合应变分辨的宏基因组学与分离株测序，我们报告了甲状腺梭菌在疗养院居民和整个都会区域的皮肤上的皮肤定植和克隆蔓延。We also report that most Enterococcus faecium, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, Pseudomonas aeruginosa and Entobacter species (ESKAPE) pathogens and other high-priority pathogens (including Escherichia coli, Providencia stuartii, Proteus mirabilis and MorganellaMorganii）在疗养院中分享。整合微生物组和临床微生物学数据，我们在识别为这些基因携带者的居民的多个皮肤部位上检测到碳青霉酶基因。我们分析了从其他七个疗养院中居住的医疗状况不同的居民收集的公开可用的shot弹枪宏基因组样品（凳子和皮肤），并提供了先前未欣赏的细菌菌株共享的其他证据。综上所述，我们的数据表明皮肤是C. auris和Eskape病原体及其相关抗菌耐药基因定植的储层。

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